其實南瓜子的營養價值很高，而南瓜子不僅僅是生吃很美味，熟吃也是很不錯的選擇，而很多時候若不是從美味程度出發，而是重視南瓜子的療效的話，一般是建議吃生南瓜子，因為熟南瓜子中的營養價值有些已經被破壞，而生南瓜子才能保持“原滋原味”。

南瓜子含有豐富的氨基酸、不飽和脂肪酸、維生素及胡蘿卜素等營養成分。經常吃南瓜子不但可預防腎結石的發生，還可促進已有結石的排出。更重要的是，南瓜子中的活性成分和豐富的鋅元素，對前列腺有保健作用。每天堅持吃一把南瓜子，可防治前列腺肥大。南瓜子含有豐富的磷，磷對男性前列腺也有好處，一些前列腺疾病就是因為缺磷造成的。雖然生吃南瓜子和熟吃南瓜子都有不一樣的美味，但是很多時候，還是建議食用生難瓜子，因為營養物質完全沒被破壞，對于治療前列腺疾病或許更有利。