AFLP的病因及發病機制尚不清晰，目前，多數人認為妊娠后體內性激素水平的變化與本病有直接關系，孕婦體內雌激素、生長激素、兒茶酚胺等水平升高，加之妊娠末期孕婦處于應激狀態，使脂肪動員增加，脂肪酸進入肝臟增加，肝內三酰甘油合成增多，糖原儲備減少，均有利于脂肪在肝細胞內沉積。

而且妊娠晚期存在不同程度的蛋白質代謝紊亂，某些氨基酸缺乏，脂蛋白缺乏，這些都有可能可促進肝細胞脂肪變性和脂肪沉積。肝腎綜合征時，腎小管細胞也會出現脂肪變，提示肝外器官也可能發生類似肝細胞受損的病理改變。由于近半數的AFLP孕婦合并先兆子癇或子癇癥狀，因此有人提出AFLP屬先兆子癇的一種特殊表現。