女性在出現(xiàn)陰壁囊腫時，通常會有其他的陰道疾病相混淆，而且在進(jìn)行診斷時，有可能會受其他因素的干擾，這個時候需要對陰壁囊腫進(jìn)行鑒別診斷。

1、囊腫會突出在陰道口或者是陰唇之間。雖然會同膀胱一樣膨出，但是在排尿之后囊腫就會縮小，或者是在用金屬導(dǎo)尿管插入，同時可以用手指擠捏囊腫的基底部，就會感覺到導(dǎo)尿管和囊腫是有一定距離。

2、陰道后的穹隆囊腫和子宮直腸窩疝需要進(jìn)行鑒別，后者是在咳嗽時由增大現(xiàn)象或者是用手指上推時會有縮小甚至是消失的情況。但是陰道囊腫沒有這些變化。

3、前陰道筆下的1/2處囊腫需要和尿道憩室以及尿道腺腫瘤進(jìn)行鑒別。后者雖然能夠形成陰道膨隆，但是會和尿道相通，再用手向前壓迫時，就會感覺到有尿液或者是膿液從尿道中流出。

4、在陰道后壁處的處女膜處小囊腫，需要和雙子宮以及雙陰道畸形進(jìn)行鑒別。這種情況是比較罕見，雖然患者有月經(jīng)，但是痛經(jīng)的情況會逐漸加重，而且在形成陰道一側(cè)囊腫張力比較大，常見紫色。