飲用決明子茶對大多數人來說是健康、有益的，不過決明子仍屬藥物的一種，既可食療，也可入藥，其藥性寒涼，并不是人人都適合喝的。決明子性涼，對于脾虛胃寒、容易腹瀉、低血壓的患者，要謹慎食用，最好咨詢過醫生飲量和飲法后再飲用。如果飲用不當，會引起腸道病變，甚至難治性便秘。

此外，決明子性涼，對女性來說，可能會攪亂經期；對于孕婦而言，可能會導致早產。有傳言，決明子加綠茶泡水喝，可以改善孕婦便秘。雖然決明子泡茶，能通便，但如果飲用過多，就會引起子宮收縮，進而起到催產作用。所以孕婦孕期便秘，還是要多吃粗纖維的蔬果，也可飲用酸奶，促進腸胃蠕動，治療便秘，又不傷害肚子里的寶寶。

對于兒童而言，飲用決明子茶，也是存在一定的副作用，如果飲用過量會導致兒童腹瀉、脫水。