孕媽媽常因一些異常情況或疾病而需要用藥物治療。用藥對胎兒的影響隨藥物種類的不同而有差別。因許多藥物可以自由地通過胎盤，有些藥物可能會引起胎兒的發育異常，甚至造成胎兒畸形，所以，原則上最好不用藥，但如有用藥的必要，則應注意以下九項原則：
一是懷孕就診要注意月經期。應告訴醫生自己已懷孕和妊娠時間；有受孕可能時，用藥需注意月經是否過期。
二是不能自行用藥。孕媽媽的疾病同樣會影響胎兒，因此既不能濫用藥物，也不能有病不用。不能自選自用藥物，一定要在醫生的指導下使用已證明對胚胎與胎兒無害的藥物。
三是可用可不用的藥物應盡量不用或少用。尤其是在妊娠的頭3個月，能不用的藥或暫時可停用的藥物，應考慮不用或暫停使用。
四是用藥必須注意孕周，嚴格掌握劑量、持續時間。
五是堅持合理用藥，病情控制后及時停藥。
六是兩種以上的藥物有相同或相似的療效時，考慮選用對胎兒危害較小的藥物。有A、B類藥可用，則應選用A類藥。在無A、B類藥可以選時慎用C類藥。D類藥只有無其他藥可選且孕媽媽病重急需用藥時才選用。對于未經動物實驗及臨床資料報道證實有無危害的藥物盡量不用。因為無資料證實不等于無危險。
七是肯定的致畸藥物禁用。
八是能單獨用藥就避免聯合用藥，能用結論比較肯定的藥物就不用比較新的藥。
九是孕期禁用試驗性用藥，包括妊娠試驗用藥。
